Checkbox'a name olarak farklı birşey vermeni öneririm. Eğer sql'den gelen verilerin haricinde bağımsız checkbox'lar varsa aşağıdaki kod onlarıda alıp işlem yapar. Id olamayacağından hataya düşürebilir.

$("input:checked").each(function()
{
 // yapılacak işlem
});

Name'i tek verdiğini varsayarsak:

$('input[type="checkbox"][name="fooo"]:checked').each(function()
{
 // yapılacak işlem
});