Sana kesinlikle katılıyorum, index sayfasında kullanılmayan kodlar içerik sayfalarında kullanılıyor olabilir. Bu tür durumlarda sorun çıkıyormu denemek lazım.

Denedim ve tabiki olmadı, bir çözüm buldum ancak çok zahmetli olacak. Tüm css dosyalarını bir çatı altında toplayacaksın. Sonra her sayfa'yı bu yöntem ile açıp o sayfanın temizlenmiş css kodlarını kayıt edeceksin ve o sayfaya gömeceksin. Artık ne kadar çok sayfan var ise o kadar çok uğraşacaksın.