list($tam,$ondalik) = explode(".",number_format( 6546546.5465, 2, ".", " "));
echo $tam."<br/>".$ondalik;
//6 546 546
//55

Kodda sorun yok. Ya değişken sorunlu ya da buraya yanlışlıkla yazmadıysanız "$say i" kısmındaki "i"yi $say'la bitişik yazın.
.
.