Arasında Fark yok. Ama şöyle bir şey var. Diyelim siz kategori oluşturdunuz.
siteadı.com/sivilce-tedavisi kategorinizin linki olacak. Burada Ya kategori temeli kullanmanız gerekecek (siteadı.com/kategori/sivilce-tedavi). Yada Sivilce tedavisi diye bir yazı yazmamanız gerekecek. Şöyle ki
Kategori linki : site.com/sivilce-tedavisi
Yazı Başlığı-Linki : Site.com/sivilce-tedavisi

Burada hangi sonuç gösterileceği karışır. Bu yüzden yazıların sonuna htm,html uzantısı eklemek bu karışıklığı engeller diye düşünüyorum