FTP, host vs tüm şifrelerinizi değiştirin. Hostunuza başvurun tekrar loglara baksınlar silinme işlemini her hangi bir ip üzerinden yapıldıysa yada bağlanıldıysa görmesi gerekir. Kendiliğinden silinebileceğini pek sanmıyorum. Güvenlikle alakalı bir durum söz konusu gibi geldi.