httpd.conf ile ilgili yazdığınız doğrudur ancak sizin sorununuz bundan olamaz, zira alt klasörlerde htaccess arayıp işlem yapıp ekrana basması milisaniyeler içinde gerçekleşir, anlık 5-10 bin istek almıyorsa sunucunuz gözle görülür bir fark kesinlikle göremezsiniz,

mod_rewrite yüklü olmasa htaccess dosyalarınız çalışmazdı, o yüzden yüklüdür (zaten sunucunuzda herhangi bir panel yüklü ise mod_rewrite da yüklüdür. Gozlerimle görmek istiyorum diyorsanız "httpd -M |grep rewrite" komutunu yazdığınızda cevap olarak aşağıdakini görüyorsanız yüklüdür.

Sunucunuz size ayrılan ramin tamamını kullanıyor görünüyor, ufaktan swap kullanmaya başlamış, detaylı incelemeden kesin konuşmak zor ancak sıkıntınız mysql yapılandırmanız da olabilir,
aşağıdaki kodları kullanarak basit bir test yaptırabilirsiniz, çıktısını paylaşırsanız yardımcı olmaya çalışalım
Ayrıca httpd.conf düzenleyerek performans elde etmek isterseniz http://httpd.apache.org/docs/2.2/tr/...rf-tuning.html adresini dikkatle incelemenizi tavsiye ediyorum.

Nginx ve Litespeed elbette size performans sağlayabilir, ancak litespeed lisans ücreti ve nginxin yapılandırma zorluğu düşünülünce günlük hitiniz 5 haneli rakamlara çıkmadığı sürece bence ikiside gereksiz.