Bilgi vermediğiniz için varsayımsal olarak yazıyorum,

Sunucunuzda kurulu İnetbase veya CSF varsa muhtemelen bu sebeple banlanıyor olabilirsiniz.

İlgili eklentileri devre dışı bırakarak bu problemden kurtulabilirsiniz.
Veya ayarlarını değiştirebilirsiniz.
Yada sürekli sunucu üzerinde banlanan ip adreslerini temizleyen bir cron hazırlayabilirsiniz.

İnetbase için,
Konsoldan aşağıdaki adımları takip ederek deneme yapabilirsiniz,
nano /usr/local/ddos/ddos.conf
NO_OF_CONNECTIONS satırını bulup karşısındaki değeri yükseltebilirsiniz.
Ayrıca ddos.confa kendi ip adresinize ekleyebilirsiniz
PROTECTED_IPS=( "192.168.1.10" )