bu isteğiniz php ile değil javascript ile yapılabilir.
Nasıl yapılabilir kısmına gelecek olursak şöyle birşey olabilir.

		Paket Seçiniz
          <select size="1" name="tarife">
		  	<?
	$bul =mysql_query("SELECT * FROM paketler");
if(mysql_affected_rows()){

    while($listeleme =mysql_fetch_array($bul)){
	echo"<option data-fiyat='{$listeleme['tutar']}' value='{$listeleme['paket']}'>{$listeleme['paket']}</option>";
	    }
}
else{ echo "<td colspan='6' align='center'>Mevcut hizmetiniz bulunmamaktadır. <br><a href='siparis.php'>Hizmet satın al</a></td>";}
?>
	</select>
        </div>
      </div>
	  	        <div class="row">
        <div class="large-4 large-centered columns">
		Toplam Fiyat (Vergiler Dahil)
          <input type="text" id="tutar" name="tutar" value="<? echo $listeleme['tutar'];?>" disabled>
        </div>
      </div>

<script src="//code.jquery.com/jquery-1.10.2.js"></script>
<script>
$( "select" ).change(function() {
    var str = $( "select option:selected" ).data('fiyat');
    $( "#tutar" ).val(str);
});
</script>

Not: option değerlerine data-fiyat diye bir alan ekledim ve o kısma paketin fiyatını yazdırdım. fiyatı yazdırdığın inputada tutar diye id değeri verdim.
javascript te selectte seçim yapıldığından seçilen option da bulunan data fiyat değerini çekip tutar inputunun value değerine atadım.