Linux genel ismidir, ubuntu linux kerneli ile çalışan bir işletim sistemidir. Yani tabir olarak ikisi farklı şeyler.

Şöyle örnekleyebiliriz,

Otomobil genel bir söylemdir, Mercedes, Opel, Volkwagen vs hepsi otomobildir.

Linux bir işletim sistemi çekirdeğidir, Ubuntu, Centos, Debian, Redhat vs bunlar hepsi linux işletim sistemidir.

http://tr.wikipedia.org/wiki/Linux

Debian packager ile çalışacağınız için debian tabanlı dağıtımlardan birini kullanmanız uygun olacaktır. Bunlar aşağıdaki gibidir, içlerinden ubuntu hem kurulumunun basit olması hemde sonrasında kolayca destek bulabileceğiniz için tavsiyemizdir.

Audiophile Linux
Canaima
Damn Small Linux
Debian JP
DoudouLinux
elive
Finnix
Kanotix
Knoppix
Linex
Linux Mint
Kali Linux
MEPIS
Pardus
Parsix
Ubuntu
Xandros


Ayrıca http://tr.wikipedia.org/wiki/Linux_d...t%C4%B1m%C4%B1 adresinede bir göz atmanız faydalı olacaktır.