amma kasmışsınız.
Kısacası;
Client(sizin yazılımınız) ->tcp/udp veri gönder(Şifrelenmiş veri)->server(gelen paketleri yorumlayıp işlem yapacak sql vs.)->veri tabanı

aynı şekilde geri dönüş olacak. Direk sql servera bağlarsanız sistemi veya soap gibi web serverlar kullanırsanız kolayca iziniz bulunur.