@exc3Lanc3 ben çıkan hataya odaklanarak birşeyler önerdim fakat farklı şeylere odaklanmamız gerekiyor aslında.

Senden yapmanı istediğim şey öncelikle convert scriptini çalıştırman;

wget -O cldeploy http://repo.cloudlinux.com/cloudlinu...s/cln/cldeploy
sh cldeploy -c

Bu şekilde LVE tabanlı tüm paketler, yum plugini ve cloudlinux deposu kaldırılacak.
Centos deposu tekrar aktif edilecek.
Cloudlinux'a ait bazı paketler kalabilir bunu problem etmene gerek yok. İlerleyen zamanlarda bu paketler centos paketleri ile değiştirilecek zaten.