benim seo tecrubeme göre site içi link yapısını bozduğunuzdan kaynaklanıyor. Google sitenin ana sayfasına ve alt sayfalarına seo puanı veriyor siz sayfaları değiştirince haliyle puanlar gidiyor ama yeni sayfalar indexleniyor ama sitenin seo puanı sıfırdan başlıyor.