kategori id'si 1 olan kategorinin link rengini değiştirmek için header.php'de </head> tag'ından hemen önce

 <?php if( in_category(1) ) { ?>
<style type="text/css">color:#000;</style>
<?php } ?>

kategori id'si 2 olan kategori için

 <?php if( in_category(2) ) { ?>
<style type="text/css">color:#000;</style>
<?php } ?>

Link şeklindeyse "a link{color:#000;} şeklinde de denemek lazım tabi siteyi görmeden fikir yürütmek zor burdan.

Kolay gelsin.