Sorunu uzun bir uğraşın ardından kendim aştım. Benim gibi sorun yaşayan olursa aşağıda vereceğim linkteki menüyü kullanıp kendilerine göre editlesinler.

http://wplift.com/wordpress-custom-m...dvice-and-help

Fonksiyon dosyasına eklenecek kodlar:
register_nav_menu( 'header-menu', 'Header Menu');

	// Or you can register multiple menus at once:
register_nav_menus(
   		array(
     			'header-menu' => __( 'Header Menu' ),
     			'Top-menu' => __( 'Top Menu' )
   		)
		  );
Menüyü ekleyeceğimiz yere eklenecek kodlar:

<nav id="access" role="navigation">

				<?php wp_nav_menu( array( 'theme_location' => 'primary' ) ); ?>
			</nav>
Ve son olarak css kodlarımız:

/*
First we prepare the navigation menu bar
 */
#access {
	background: #4572BF; /* Show a solid color for older browsers */
	background: -moz-linear-gradient(#4572BF, #6187C7);
	background: -o-linear-gradient(#4572BF, #6187C7);
	background: -webkit-gradient(linear, 0% 0%, 0% 100%, from(#4572BF), to(#6187C7)); /* older webkit syntax */
	background: -webkit-linear-gradient(#4572BF, #6187C7);
	-webkit-box-shadow: rgba(0, 0, 0, 0.4) 0px 1px 2px;
	-moz-box-shadow: rgba(0, 0, 0, 0.4) 0px 1px 2px;
	box-shadow: rgba(0, 0, 0, 0.4) 0px 1px 2px;
	clear: both;
	display: block;
	float: left;
	margin: 0 auto 6px;
	width: 100%;
}

/*
Now we style the unordered list, hover effect, and sub menus
 */

#access ul {
	font-size: 13px;
	list-style: none;
	margin: 0 0 0 -0.8125em;
	padding-left: 0;
}
#access li {
	float: left;
	position: relative;
}
#access a {
	color: #eee;
	display: block;
	line-height: 3.333em;
	padding: 0 1.2125em;
	text-decoration: none;
}
#access ul ul {
	-moz-box-shadow: 0 3px 3px rgba(0,0,0,0.2);
	-webkit-box-shadow: 0 3px 3px rgba(0,0,0,0.2);
	box-shadow: 0 3px 3px rgba(0,0,0,0.2);
	display: none;
	float: left;
	margin: 0;
	position: absolute;
	top: 3.333em;
	left: 0;
	width: 188px;
	z-index: 99999;
}
#access ul ul ul {
	left: 100%;
	top: 0;
}
#access ul ul a {
	background: #f9f9f9;
	border-bottom: 1px dotted #ddd;
	color: #444;
	font-size: 13px;
	font-weight: normal;
	height: auto;
	line-height: 1.4em;
	padding: 10px 10px;
	width: 168px;
}
#access li:hover > a,
#access ul ul :hover > a,
#access a:focus {
	background: #efefef;
}
#access li:hover > a,
#access a:focus {
	background: #f9f9f9; /* Show a solid color for older browsers */
	background: -moz-linear-gradient(#f9f9f9, #e5e5e5);
	background: -o-linear-gradient(#f9f9f9, #e5e5e5);
	background: -webkit-gradient(linear, 0% 0%, 0% 100%, from(#f9f9f9), to(#e5e5e5)); /* Older webkit syntax */
	background: -webkit-linear-gradient(#f9f9f9, #e5e5e5);
	color: #373737;
}
#access ul li:hover > ul {
	display: block;
}
/*
Styling the currently rendered page
 */
#access .current-menu-item > a,
#access .current-menu-ancestor > a,
#access .current_page_item > a,
#access .current_page_ancestor > a {
	font-weight: bold;
}
Aşağıdaki menüyü wp'ye entegre edip kullanmaya çalışıyorum ancak başaramadım. Bu konuda bana yardımcı olmanızı bekliyorum. İyi çalışmalar.

 <div class="menu">
        <ul>
            <li class="acilir"><a href="#">Ana Sayfa</a>
            	<ul>
                    <li><a href="#">Kurumsal</a></li>
                    <li><a href="#">Kurumsal</a></li>
                    <li><a href="#">Kurumsal</a></li>
                </ul>
            </li>
            <li><a href="#">Kurumsal</a></li>
            <li><a href="#">Birimler</a></li>
            <li  class="acilir"><a href="#">Bilgi Edinme</a>
            <ul>
                    <li><a href="#">Deneme</a></li>
                    <li><a href="#">Deneme</a></li>
                    <li><a href="#">Deneme</a></li>
                </ul>
            </li>
            <li><a href="#">E-hizmetler</a></li>
            <li><a href="#">İletişim</a></li>
        </ul>
    </div>