WP dosyaları bozulmaz. Ama site veritabanı gereksiz yere şiştiği bir müddet sonra yavaşlama olabilir.
Gereksiz tabloları silen bazı eklentiler var ama hiç kullanmadığım için ne kadar işe yarar bilemiyorum.
O eklentiler gereksiz tabloları değilde daha çok tablolardaki gereksiz bilgileri siliyor. Mesela yazı sürümlerini. Ama direk tablo silmek gerek. Mesela GD Star ratingi sildik diyelim veritabanında wp_gd ile başlayan bütün tabloları kaldırmak gerek ama elle. riskli tabi