echo'da verdiğin çift tırnaklar html de ki çift tırnaklarla karışıyor sanırım. Echo'da tek tırnak kullanırsan düzelir diye düşünüyorum. Sanırım aşağıdaki gibi olacak:

echo '<li><a href="'.$config["http_home_url"].$row['alt_name'].'/'.$row2['alt_name'].'">';