Bildiğim kadarıyla direk her saniye çalıştıramıyoruz. Ben loop ile yapıyorum. Dosyayı dakikada bir kere çalıştırıyorum ve her çalışmasında 1er saniye aralıklarla 60 defa benim istediğimi yapıyor

set_time_limit(60);
for ($i = 0; $i < 59; ++$i) {

    // islemler burada
    sleep(1);
}