Sitenizden kağnaklı 404 Hatalarıysa. Yani
www.sitenizinadresi.com/asdasd.htlm şeklinde verdiği linke tıkladığınızda linki bulamıyorsa.
Eğer düzelte bileceğiniz bir link ise düzeltin ve düzeltildi olarak işaretleyin.
Eğer Düzeltemeyeceğiniz linkse;
Google Webmaster Tools'ta Google dinizi Bölümünde Url kadır var ordan kaldırın.
Kendi Sitenizden değilde Site Dışından gelen linkler için Disallow link reddetme aracı kullanılır.
not: Bana Göre ufak tefek hataların zararı olmuyordur. Ama çok sayıda 404 illaki zararı vardır diye düşünüyorum..