Hostum ile bir şekilde kurduk paylaşayım dedim başkalarına faydalı olur inşallah
1. zppy repo add zppy.alineofcode.co.uk // If you haven't added my repo yet
2. zppy update
3. zppy install ajaxplorer
4. cd /etc/zpanel/panel/etc/apps/
5. chmod -R 777 ajaxplorer/data
6. mkdir ajaxplorer/data/tmp/sessions

Ek olarak max upload filan ayarlanabiliyor galiba (denemedim)
upload_max_filesize
post_max_size
memory_limit