$metin = 'haber365, haber365.com, haber, haberler, 3,metrelik,4,timsah,5';

echo preg_replace("/(\s|^|\W)([a-zA-Z0-9]){1}(\s|$|\W)/si",'$1', $metin);
böyle dene bakalım istediğin gibi olmuşmu