Hangi amaç için kullanacaksınız sanırım .net.tr aldığınıza göre hosting ile ilgili olacak.Böyle olacaksa benim tercihim .net.tr ile .com.tr birarada ana sitede kullanmak olur diğer uzantılardanda atıyorum sınırsız reseller satış siteniz yapabilirsiniz.Tamamen mantık yürüttüm konuya bakarak.Diğer türlü Türkiye hiti içinse .com.tr'yi kullanır .com'uda .com.tr'ye yönlendirirdim.