Eğer kategori, etiket vs. sayfalarında da ana sayfadaki görüntüyü kullanmak istiyorsanız, index.php bütün hepsini göstermeye yeter.
Yani ortada bir yanlışlık yok, bu WordPress'in tema yapısının esnekliğinin bir göstergesidir.
Kategori, etiket sayfalarına farklı görünümler, farklı özellikler eklemek isterseniz de bahsettiğiniz gibi index.php dosyasını klonlayıp, category.php, tags.php gibi dosyalar oluşturup, değişiklik yaparak kullanabilirsiniz.