kullanıcı kayıt olduğunda kullanıcının "onay" özel alanına add_user_meta() ile false değerini ekletin.

işlemlerinizi de ufak bir kontrol fonksiyonu ile if else şeklinde kontrol ettirerek yapın :

if( uye_onayli_mi($current_user->ID) ) {

gibi..

zamanında yazmıştım bu tarz bir eklenti. dilerseniz size de yazabilirim ücreti ile. iyi çalışmalar.