şöyle açıklayım kullandığın yazılım php/asp fark etmez bunların session yapma izinleri var (js ilede yapanlar var nasıl yapılıyor bilmiyorum) bir session oluşturursun örneğin "bugun" isminde ilk açıldığında bu session varmı diye bakacaktır olmadığı için popup açılacaktır ve session oluşturulacaktır (24 saatlik)
bir sonraki güne kadarda o popup açılmayacaktır.

örnek olarak klasik asp ile

<% Session.Timeout = (24*60*60) %> 

<% if session("bugun")="" then %>
popup kodların

<% session("bugun")="acildi" %>
<% end if %>