ls komutun gayet güzel çalışıyor,

sen /root/ klasörü içinde o komutu veriyorsun oda sana içindekileri listeliyor. pwd yazarak bulunduğun klasörü öğrenebilirsin.

linuxta ana dizin "/" ile gösterilir.

ls /

komutu verirsen kök dizini görebilirsin.

arkadaşın dediği gibi /var/www/vhosts/fllrt.com/etc/php.ini dosyasında düzenleme yapmalısın.