eğer sef link yapısı kullanıyorsan tam adresle birlikte dene örn:
echo '<link rel="stylesheet" href="http://www.site.com/Temalar/'.$SiteTema.'/style.css" type="text/css" />';

sitenin kaynak kodunda bu satıra bakarak $siteTema nın yazdırılıp yazdırılmadığınıda kontrol etmelisin belki sorun oradadır değişken boştur veya farklı basit bir hata vardır.