echo "<center><h2>Kategoriler</h2>";
	$sql = mysql_query("SELECT * FROM forum_kategori");
	echo "<div class='CSSTableGenerator'><table><tr><td><center><font color=red><b>Kategori Adı</td><td><center><font color=blue><b>Konu Sayısı</td></tr>";
	while($cek = mysql_fetch_array($sql)){
	$id = $cek['id'];
	$sqll = mysql_query("SELECT * FROM forum_konu WHERE kategoriid=$id");
	$say = mysql_num_rows($sqll);			
	echo "<tr>";
	echo "<td><center><a href='index.php?sayfa=kategori&katid=$cek[id]' >$cek[kategoriadi]</a></td>";
	echo "<td><center>$say</td>";
	echo "</tr>";
	}
	
	echo "</table></div>";

şeklinde dene...

sorgu sayısı çok fazla ise de hata verir , sen kodları tam araştırmadım ama 500 binden fazla kayıt çekiorsan sql düzenlemek gerekir