Problemlerin sizin komutlarınız yada benim komutlarımın kullanılmasıyla bir alakası yok.
Kullanılan files'ın hataları yada chmod kaynaklı hatalar.
Dolayısıyla mysql-5.0 kurulumunda hata alan bir kişi fbsd'yi en baştan kurup portsnaplar ardından mysql 5.5 kurulumuna devam etmeli.
Neticede sorun komut kaynaklı değil.