Sunucunuz varsa kontrol paneli üzerinden yedeklemeyi zamanlayarak ya da ssh üzerinden bash script ile bunu otomatikleştirebilirsiniz.

Eğer hosting-reseller dan bahsediyorsanız plesk panelde bunu yine panel üzerinden zamanlayabilirsiniz, cpanelde ise cpanel fonksiyonlarını kullanarak yedek alan php script mevcut bunu cronjoba tanımlayarak her şekilde yedeklerinizi otomatikleştirmeniz mümkün.