ozaman şöyle diyim ftp ile alaklı bir durum söz konusu değilse phpmyadmin'den o site adını aratıp çıkan sonuçlarla kendi site adresini değiştirip sürüm güncellerse sorun yaşacağını zannetmiyorum.
bu çok kısıtlı bir öneri oldu,
shared host üzerinde barınıyor ise sunucu üzerinde farklı bir kullanıcı hesabı ile erişim sağlayabilir.
config bilgileri elinde ise remote mysql connection deneyebilir
bir şekilde ftp üzerinde önceki erişimi sebebi ile bir listpatch bırakmış olabilir
bir şekilde önceki erişimi sebebi ile ilgili script üzerinde farklı php dosyalara kendine ait birtakım kodlar eklemiş olabilir
olabilitesi çok işlem var aklıma gelenler sadece bunlar.
Çok önemsediğiniz bir proje ise geniş çaplı araştırma gerekir.