mysql_result(mysql_query("select count(mesajlar) from mesajlar where konuid = '$konuid' or konuid = '$ustkonuid'"),0);Şeklinde denermisin?
Böyle sadece o id'nin ve üst id'nin mesaj sayısını görebilirsin.
Senin yazdığına göre ben örneğin ; id si 5 olanın mesajına ve bunun da üst id'si 2 olanın mesajına ulaşırım.
Ama benim istediğim id'si 1 olanın alttında olan alt konuların mesajlarıyla kaç tane mesajı var.