iframe ile çekeceksen zaten link konusunda sıkıntı olmaz link de iframden gelir.
yapacağın her banner için bir reklam dosyası oluşturmak. reklam1.html, reklam2.html, reklam3.html ve bu dosyaların için gerekli bannerı ve linkini koymak

sonra reklam göstereceğin sayfaya bu reklamları şu kodla include edeceksin. rastgele olarak gösterecek.

include('reklam'.rand(1,3).'.html');