index.php dosyasının en başına

global $website

eklerseniz sorun ortadan kalkar ama ne denli sağlıklı olur bilmem

bunun yerine index.php dosyasında kullanacağınız fonksiyonlar için ayrı bir class tanımlayıp o şekilde de kullanabilirsiniz.
ya da extends ile iki classı birleştirebilirsiniz ( denemedim ama çalışır galiba )