PHP taglarının arasına yerleştiriyor olmanız HTML veya CSSyi etkilemeyeceği anlamına gelmiyor. Chrome kullanıyorsanız F12 basıp o bölgenin CSS kodunu alın birde hatalı göründüğü zaman aynı işlemi yapın arada nasıl bir değişiklik varsa include edilen dosyalardan bulun başka çaresi yok.