$yayinda = mysql_query("SELECT SUM(puan) as tpuan, takim,SUM(averaj) as averaj FROM puantablosu GROUP BY takim ORDER BY tpuan desc ");

$takim= $listele ['takim'];
$tpuan = $listele ['tpuan'];
$averaj = $listele['averaj']; // bu şekilde averajı ekleyebilirsin.


// Bu şekilde 1. ve 2. takımın puanları eşitse averajda kim üstünse o 1. sıraya çıkar.

for($x=1;$x<=2;$x++){
$averaj = $listele['averaj'];
if($averaj == $averaj){
$a = mysql_query("SELECT SUM(averaj) as averaj FROM puantablosu GROUP BY takim ORDER BY averaj desc limit 2");
$sorgu = mysql_fetch_assoc($a);
$averaj = $sorgu['averaj'];
echo $averaj;


}

}
Bu şekilde çalışıyor olması gerekiyor. saat 03:40 hata varsa kusura bakmayın.

Saygılarımla.