Peki şöyle dene o halde...
<div id="navwrap"> satırının hemen üstüne <div style="float:right;">Reklam Kodu</div> koy
Gerçekten çok teşekkür ederim. Navwrapper'dan önce kodu girince tabi hizalamayı sitenin tamamına göre yapıyordu; şimdi temaya göre yaptı ve sorun çözüldü.