iso-8859-9 ile genelde sorun yaşarsınız. Benim tavsiyem her zaman utf-8 kullanmanız.

veritabanınızı utf8 olarak biçimlendirin, bağlantı kodlarınıza:

mysql_query("SET NAMES 'utf8'");
mysql_query("SET CHARACTER SET utf8");
mysql_query("SET COLLATION_CONNECTION = 'utf8_turkish_ci'");

ekleyin.

sayfanızda en başa header olarak:

header("Content-Type: text/html; charset=utf-8");

ve head kısmına meta olarak:

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />

ekleyin.Tinymce kullanıyorsanız da Tinymce'yi sayfanıza entegre ettiğiniz kodlara:

entity_encoding : "utf-8",

ekleyin, ne sayfanızda, ne veritabanında hiç bir sorun yaşamazsınız.