whmcs 4.x serisi kullananlarda paypal açıığı mevcutmuş, 5.x serisini kullananlar bu açıktan etkilenmezlermiş ancak 5.x serisinde ise Google Checkout modülü üzerinden Sql enjekte açığı mevcutmuş, Google Checkout kullanmıyorsanız sorun olacağını zannetmiyorum.

Son sürüm dosyalara whmcs.com kullanıcı panelinden ulaşabilirmişiz, ayrıca

4 serisi için http://go.whmcs.com/42/v452patch
5 serisi için http://go.whmcs.com/46/v512googlecheckoutpatch

yamaları vermiş, ilgili yama sürümünü indirip orjinal dosya ile değiştirmeniz yeterlidir.