istediğin şey javascript ile yapılıyor.

Ajax ile sayfalarını değiştireceksin.
Belki window.history.pushState gibi fonksiyonlar ile "#" hash işlemek isteyebilirsin. site.com/proje#index site.com/proje#login, site.com/proje/#login site.com/#!index gibi değişik şeyler olabiliyor.
Ve site içi linkleme yapabilirsin bu şekilde. Yine javascript ile gelen uri metinlerini parselleyip ajax ile sayfalarını çağırarak linkleme yapabilirsin.

Sitelerin yönetim panellerinde birkaç senedir bunu kullanıyorum artık, hem daha hoş oluyor sayfa geçişleri şarjör değiştirir gibi olmuyor. Loading resmi koyuyorum tam orta pozisyona, her sayfada css js yüklemiyorum belki birkaç js fonksiyonu bu kadar..

iyi çalışmalar