Arkadaşım veri GEt ile geldiği için o şekilde oluyor. Linkde ki karakterlerde encopde edilip gönderilir. Yani sana:

http://localhost/index.php?kategori=http%3A%2F%2Fwww.siteismi.com%2Fkonu%2Fkonu2%2Fkonu3.html

şeklinde gelen linki:

echo $_GET['kategori'];

dediğin zaman http://siteismi.com/konu/konu2/konu3.html diye verir. Daha sonra o değeri alıp istediğin yerde kullanabilirsin.

Uzun lafın kısası anormal bir durum yok. Senin burada ki problemini tam olarak anlayamadım.