c:\> konumundayken bunu yazınca doğru sonucu alıyorum
Mp4Box.exe -inter 500 "G:\\habervideo\\19.10.2012\\SOKAK.mp4"
bu kodu bir bat dosyası içine kaydet, ve exec('c:\xxx.bat'); şeklinde php ile çalıştır.
Çalışmıyorsa php "o klasörde" ya da "o programla" o işlemi yapmak için yetkili değildir.