Şu var en küçük ihtimalleri bile sayayım siz ;

* Eğer yedekleri Cpanel'den alıyorsanız yeni yedeklemelerde eski yedekleriniz FTP'de olacağı için eskiler yeni yedeklerin içerisine girer ki bu yedeği yüklerken sorun çıkartır , lakin siz SQL yedeğinden bahsediyorsunuz sanırım.

Birde bazen yedek alımlarında Cpanel hata yapabiliyor , ben birkaç kere yaşadım hasarlı olduğundan yüklenememişti host firması bana böyle bildirmişti. Yine aynı sizin taktiğinizle eski yedekleri kullanmıştım.

İyi çalışmalar