kusuruma bakma yanlış anlamış olabilirim seni. saatte geç değil ama demekki benim saatimde değilim anladığım kadarıyla yorum yapayım tekrardan.

şimdi veritabanının bir kısmında linklendirilmiş yazılar var demekki ?
evet var.
Amacımız o yazıları tekrar linklememek?
evet.
sorgumuzu alıp şu halde çalıştırıyoruz önce

update wp_posts set post_content = replace(post_content, '<a target="_blank" href="http://site.com/tag/kelime1/">kelime1</a>', 'kelime1');

daha sonra şu sorguyu çalıştırıyoruz.
update wp_posts set post_content = replace(post_content, 'kelime1', '<a target="_blank" href="http://site.com/tag/kelime1/">kelime1</a>');

şu eklenti işini tamamen bi kaldıralım bu arada

mantık olarakta şunu yaptım. linklendirilmiş yazılardaki linki kaldırdım önce sonra tüm yazılara linki ekledim.