siteniz imzanızdaki site ise httpd kendini durdurmuş belliki . yigit0can arkadasın dediği gibi cache sistemi önemli . var demişsiniz o zaman tek site için sunucuya panel kurmamanızı öneririmki sizin sunucuda cpanel mevcut.
5k lık bir siteniz var en az 2gb ramli bir makine öneriyorum.
sunucuya sadece php , mysql ve phpmyadmin kurun . Panele ihtiyac yok aslanlar gibide çalışır sunucu.Sitenizdede kesintiye uğramazsınız.

bu arada basit bir bash script yazıp cron işlemlerine eklerseniz 1 saate 1 defa httpd ye restart çeker geçiçi çözümdür siz daha güçlü bir sunucuya geçip optimizasyonunu tamamlayana kadar.