Headera ne gibi bilgiler yollayacağına göre değişebilir. Örneğin aktif sayfa için ayrı bi title vermek istersen.

<?php 
    // controllers/example.php içeriği 
    class Example extends CI_Controller 
    { 
        public function __construct() 
        { 
            parent::__construct(); 
        } 

        public function index() 
        { 
            $data['title'] = 'Anasayfa';
            $data['view']  = 'category/index'; 
            $data['text']  = 'Hello wolrd'; 
            $this->load->view('index', $data); 
        } 
    } 
?> 


     
<?php 
    // views/index.php içeriği 
    $this->load->view('sections/header', array('title' => $title)); 
    $this->load->view($view); 
    $this->load->view('sections/footer'); 
?> 

<?php  
    // views/category/index.php içeriği 
    echo $text; 
?>

<?php 
    // views/sections/header.php içeriği
    echo $title;
?>

Yada bir kütüphane oluşturup bu kütüphane ilede header a veri aktarabilirsin. Sana kalmış.

$header = $this->load->view("header_view",$headerdata,TRUE)

bu kod application/views klasörü altındaki header_view.php dosyanı include eder ve include ederken içine de $headerdata dizisini veri olarak gönderir.

sonrada bunu dizi olarak anasayfana gönderirsen o dizi içindeki değeri yazdırdığın yerde bu sayfayı include etmiş yazdırmış yada her ne demek istersen onu yapmış olursun

eğer daha detaylı bilgi istersen skype ve teamviewer üzerinden yardımcı olabilirim. pm atman yeterli.