Malesef olmadı. 0,2 yazdığım zaman yine aynısı oluyor. Bu arada ben 7 ve 4 satırlık örnek verdim ama gelen sonuçlar daha fazla.

$query2 = mysql_query("SELECT musteri.Firma_Adi, musteri.Adres, musteri.Sehir, musteri.Ulke, musteri.Vergi_Dairesi, musteri.Vergi_Numarasi, musteri.Telefon, musteri.Faks, musteri.Yetkili_Kisi_1, musteri.Yetkili_Kisi_1_Mail, 
Fatura.Para_Birimi, Fatura.Fatura_No, Fatura.Tarih, Fatura.Aciklama, Fatura.Genel_Toplam
					FROM musteri
					LEFT JOIN Fatura ON musteri.ID = Fatura.Musteri 
					WHERE musteri.ID='$id'
					ORDER BY Fatura.Tarih ASC
					LIMIT 0,2");
					

$query3 = mysql_query("SELECT musteri.Firma_Adi, musteri.Adres, musteri.Sehir, musteri.Ulke, musteri.Vergi_Dairesi, musteri.Vergi_Numarasi, musteri.Telefon, musteri.Faks, musteri.Yetkili_Kisi_1, musteri.Yetkili_Kisi_1_Mail, 
Odeme.Tarih, Odeme.Odeme_Tipi, Odeme.Miktar, Odeme.Birim, Odeme.Aciklama
					FROM musteri
					LEFT JOIN Odeme ON musteri.ID = Odeme.Musteri_ID 
					WHERE musteri.ID='$id'
					ORDER BY Odeme.Tarih ASC
					LIMIT 0,2");

şeklinde sorgularım var ve dediğiniz gibi limit 0,2 ekleyince

1. satıra 1. veritabanından gelen bilgiyi çekiyor
2. satıra 2. veritabanından gelen bilgiyi çekiyor
3. satıra 2. veritabanından gelen bilgiyi çekiyor
4. satıra 1. veritabanından gelen bilgiyi çekiyor

şeklinde sonuç verdi.

benim istediğim 1 1. sorgudan veri çeksin 1 2. sorgudan veri çeksin ve bu şekilde devam etsin şeklinde