Smfde seo eklentisi kurunca linklerin değiştiği yok yine olmaz dediğin htaccess kullanıyor, htaccess kullanarak site.com/kategori/konu adresine gidildiğinde site.com/$kategori/$konuid
olarak okutmasını sağlayabilirsin, yönlendirme yapmaz link sabit kalır googleda o şekilde indexler, sitedeki tüm linkleride birkaç küçük ayarla öyle yaparsın.

sef link olarak arama yapabilirsin.