Peki bunları otomatik olarak eklemeyi denesen?

Örneğin <ul></ul> arasındaki kodları kaldır. Yerine

<?php wp_list_categories('orderby=ID&title_li=&echo=1&hi de_empty=0&exclude=3,4,5,6,7,8'); ?>

kodunu ekle. 3,4,5,6,7,8 şeklinde yazdığım o menüde görünmesini istemediğin kategoriler olur.Eğer buna ihtiyacın yoksa &exclude=3,4,5,6,7,8 kısmını silmen yeterli. Hem oluşturduğun kategoriyi tekrar eklemek zorunda kalmazsın, hem bağlantı sorunu yaşamazsın.