Küçük bir düzenleme ile sorunu çözdüm, yardımcı olmak isteyen arkadaşlara teşekkür ederim. Benim gibi acemi arkadaşlara faydası olur belki düzenlenmiş hali ektedir. Arayınca bulsunlar diye!

	<?
$q1=mysql_query("select  * from sehir where onay=1 order by ad");
while ($r1=mysql_fetch_array($q1))

 {	?>
 
  <?=$r1[ad]?> 
     <br>
 
 <?
 $q2=mysql_query("select  * from nerede where il = '$r1[id]' ");
while ($r2=mysql_fetch_array($q2))
	{ 		
?>
    	 
	
     (<?=$r2[ad]?>)<br> 
     <?}?>
    
         
<?}?>