Safe Mod güvenlik ayarları yüzünden script içinde dosya işlemi yapmanız kısıtlanmış. makedir çalışıyor ama opendir readdir fonksiyonları kısıtlanmış.
dosya sayısı fazla değilse opendir readdir kullanmadan
her dosya için tek tek elle copy komutu yazarak deneyin.

if (!copy("/kaynak_klasor/kaynak_dosya1.jpg", "/hedef_klasor/hedef_dosya1.jpg")) { 
echo "kopyalama basarisiz"; 
}else{ 
echo "dosya basariyla kopyalandi.<br>"; 
} 
if (!copy("/kaynak_klasor/kaynak_dosya2.jpg", "/hedef_klasor/hedef_dosya2.jpg")) { 
echo "kopyalama basarisiz"; 
}else{ 
echo "dosya basariyla kopyalandi.<br>"; 
}